More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3179 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5188  response regulator receiver protein  99.01 
 
 		 101 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  60.71 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  50.94 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  51.49 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  46.3 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 256 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 128 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 210 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 221 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  45.54 
 
 		 204 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 224 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 203 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  41.67 
 
 		 205 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1518  response regulator receiver protein  40 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  39 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  39 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 230 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  38.89 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  41.18 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  38.18 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.57 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 277 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  40.78 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 208 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 224 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 		 454 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 208 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  41.35 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  35.19 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>