125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2445 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  100 
 
 		 137 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  100 
 
 		 137 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  99.27 
 
 		 137 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  89.05 
 
 		 137 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  97.08 
 
 		 137 aa  235  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  89.78 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  89.78 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  83.33 
 
 		 170 aa  201  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  72.66 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  83.33 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  77.97 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  50 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  52.34 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  54.26 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  46.56 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  52.38 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  47.24 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  50.48 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  54.14 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  53.12 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  50.78 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  50.78 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  51.15 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  32.59 
 
 		 281 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.85 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  39.69 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  41.3 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  41.53 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  42.75 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  43.1 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  40.58 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  40.19 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  40.52 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  40.44 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  37.12 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  42.86 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.81 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.52 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  41.56 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  37.5 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  39.02 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.69 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  41.76 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.26 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  41.76 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.68 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  33.85 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  42.55 
 
 		 239 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.59 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.69 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  38.73 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  40.32 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  63.89 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.73 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.27 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.55 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  32.56 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  32.54 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  37.72 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  35.48 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  35.2 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  43.2 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  35.11 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  44.88 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  32.81 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  41.6 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.98 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.69 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  42.99 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  34.68 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  45 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  33.81 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  38.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  37.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  33.78 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  34.38 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  44.26 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.68 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  38.1 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  37.18 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>