More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3348 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 349 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.28 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  25 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.2 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.96 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 		 383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.49 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  32.26 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  30.9 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.83 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.51 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  35.67 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  31.47 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.53 
 
 		 404 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  36.05 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.37 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  31.37 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.43 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  26.6 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.48 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  30.71 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 365 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  33.89 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  41.13 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  34.63 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.9 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.15 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  32.93 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>