More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2732 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  100 
 
 
552 aa  1051    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  63.14 
 
 
553 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  59.57 
 
 
548 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  50.81 
 
 
554 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
562 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  61.22 
 
 
671 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
566 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
548 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.54 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  44.22 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.93 
 
 
509 aa  270  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  39.14 
 
 
537 aa  260  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
563 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  40.77 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.35 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  39.36 
 
 
603 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.15 
 
 
585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  39.78 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
551 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  35.34 
 
 
563 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
546 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  31.94 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  32.97 
 
 
537 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.42 
 
 
583 aa  196  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3420  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
554 aa  196  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.59 
 
 
550 aa  195  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  26.79 
 
 
634 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
550 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.47 
 
 
767 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  28.99 
 
 
581 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  35.19 
 
 
550 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
560 aa  186  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 
606 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 
555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  33.02 
 
 
672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  32.27 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.05 
 
 
555 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.83 
 
 
637 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  29.04 
 
 
634 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  34.71 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  34.71 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  34.71 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  25.95 
 
 
639 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  23.75 
 
 
577 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.33 
 
 
532 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  34.54 
 
 
537 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
659 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  27.75 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
658 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
644 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  28.62 
 
 
659 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  30.4 
 
 
631 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 
622 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  32.83 
 
 
652 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
631 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  27.75 
 
 
640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  30.59 
 
 
653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  27.52 
 
 
658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
644 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  35.31 
 
 
548 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
662 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  29.5 
 
 
644 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  32.51 
 
 
621 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  28.98 
 
 
530 aa  180  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
551 aa  179  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
630 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 
555 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  32.35 
 
 
609 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
561 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.67 
 
 
559 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 
550 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 
638 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  32.24 
 
 
591 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  30.5 
 
 
564 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2620  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.35 
 
 
549 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  30.42 
 
 
659 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3426  ABC transporter related protein  30.15 
 
 
554 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  33.7 
 
 
533 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.77 
 
 
634 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  32.46 
 
 
624 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  27.66 
 
 
685 aa  177  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 
555 aa  177  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  28.44 
 
 
629 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  33.03 
 
 
569 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.63 
 
 
600 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.1 
 
 
637 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 
532 aa  176  8e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.21 
 
 
636 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  29.29 
 
 
635 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.08 
 
 
635 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 
663 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>