More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1574 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  81.13 
 
 		 212 aa  364  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  86 
 
 		 222 aa  357  6e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  79.52 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  80.3 
 
 		 200 aa  338  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  79.29 
 
 		 200 aa  337  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  77.32 
 
 		 200 aa  314  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  75.13 
 
 		 197 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  75 
 
 		 197 aa  304  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  75.26 
 
 		 195 aa  304  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.36 
 
 		 204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.6 
 
 		 197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  72.45 
 
 		 197 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  71.94 
 
 		 197 aa  298  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  71.94 
 
 		 197 aa  298  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  72.59 
 
 		 197 aa  298  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.23 
 
 		 201 aa  297  8e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.47 
 
 		 201 aa  297  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  71.57 
 
 		 198 aa  295  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.56 
 
 		 199 aa  292  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.64 
 
 		 202 aa  292  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.26 
 
 		 195 aa  286  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  67.01 
 
 		 195 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  69.59 
 
 		 197 aa  278  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.69 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  68.21 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.5 
 
 		 203 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  63.38 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  64.58 
 
 		 195 aa  257  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  61.86 
 
 		 195 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  63.59 
 
 		 195 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  61.73 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  61.34 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  62.5 
 
 		 195 aa  241  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.21 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.76 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.83 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  51.2 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.69 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  49.76 
 
 		 214 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  49.28 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  50.72 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  48.8 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  49.28 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  50.79 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.28 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.79 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.33 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.48 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  49.28 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.76 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  49.28 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.82 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  49.76 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  49.28 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.94 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  48.33 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  48.45 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 212 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  47.85 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  47.37 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  47.14 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  47.62 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  47.14 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  46.89 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>