More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0195 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.73 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.06 
 
 		 203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  55.29 
 
 		 218 aa  210  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  51.52 
 
 		 200 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  51.52 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  55.26 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  55.79 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  55.26 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  55.26 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  55.26 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  54.74 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  53.85 
 
 		 214 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.77 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  54.74 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.45 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  52.02 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  54.21 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.89 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  54.74 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  53.89 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.64 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  53.37 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  52.48 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  52.48 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.45 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  53.11 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  50.77 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  49.06 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.24 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  51.24 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  52.4 
 
 		 214 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 		 212 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  51.92 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.77 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  51.44 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  51.44 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  51.92 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  51.44 
 
 		 216 aa  195  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  52.74 
 
 		 217 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.72 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.5 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 214 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  51.72 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  51.44 
 
 		 214 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 		 195 aa  194  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.89 
 
 		 240 aa  194  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.45 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.96 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  50.96 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  50.48 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  50.96 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  51.44 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  47.18 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.18 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  49.76 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.25 
 
 		 195 aa  191  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  48.45 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  50.74 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>