More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2136 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  92.39 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  90.82 
 
 		 197 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  91.33 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  91.33 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  83.76 
 
 		 198 aa  338  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.65 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  73.6 
 
 		 200 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.6 
 
 		 222 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  74.87 
 
 		 195 aa  305  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  71.57 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.96 
 
 		 197 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.71 
 
 		 195 aa  301  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.08 
 
 		 212 aa  301  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  72.59 
 
 		 212 aa  298  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.16 
 
 		 200 aa  295  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.72 
 
 		 204 aa  295  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.56 
 
 		 213 aa  293  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  69.15 
 
 		 202 aa  287  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.51 
 
 		 199 aa  280  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.33 
 
 		 201 aa  276  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.51 
 
 		 201 aa  275  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.64 
 
 		 195 aa  263  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  65.15 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  67.01 
 
 		 197 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  67.18 
 
 		 195 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  64.43 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.13 
 
 		 198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  60.71 
 
 		 198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  61.54 
 
 		 195 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  61.69 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  58.76 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  59.79 
 
 		 195 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  59.9 
 
 		 195 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  59.38 
 
 		 195 aa  224  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.21 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.72 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.76 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.08 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.15 
 
 		 216 aa  175  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.45 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  45.96 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  45.18 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  45.18 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.69 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.71 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  44.16 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  46.23 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  41.33 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  45.59 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.57 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  45.1 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  44.28 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  40.4 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  45.23 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  44.23 
 
 		 215 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  42.64 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  47.4 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  44.22 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  46.08 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.5 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  42.06 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  46.46 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  41.01 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>