More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1922 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  99.49 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  91.33 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  91.33 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  84.69 
 
 		 198 aa  339  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.53 
 
 		 197 aa  311  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  75.9 
 
 		 195 aa  310  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  72.45 
 
 		 200 aa  309  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.96 
 
 		 212 aa  308  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  71.07 
 
 		 200 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.98 
 
 		 222 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  71.94 
 
 		 212 aa  298  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.45 
 
 		 197 aa  298  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.71 
 
 		 204 aa  298  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.92 
 
 		 213 aa  297  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.16 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.65 
 
 		 200 aa  291  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.88 
 
 		 199 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.34 
 
 		 202 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.02 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.5 
 
 		 201 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.65 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  68.21 
 
 		 195 aa  267  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  68.04 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  66.67 
 
 		 195 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  65.46 
 
 		 195 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  62.44 
 
 		 198 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  64.14 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  62.56 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  58.76 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  60.7 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  59.79 
 
 		 195 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  59.38 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  59.38 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 		 195 aa  197  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.69 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.5 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.85 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.52 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.08 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.45 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  45.18 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.71 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  45.41 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  45.41 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  46.35 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  45.41 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  45.93 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  44.98 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  46.35 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  46.6 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.23 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  43.78 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.45 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  43.72 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  41.41 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.14 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.41 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  42.5 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>