More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2518 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2518  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2255  isopropylmalate isomerase small subunit  91 
 
 
200 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000308892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1574  isopropylmalate isomerase small subunit  79.29 
 
 
212 aa  337  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  77.27 
 
 
222 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11110  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  77.78 
 
 
212 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2356  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  77.78 
 
 
213 aa  328  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08750  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  76.5 
 
 
201 aa  324  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00132575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4226  isopropylmalate isomerase small subunit  74.62 
 
 
197 aa  315  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3214  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  75.13 
 
 
197 aa  311  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0199989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  72.96 
 
 
201 aa  310  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.778348  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1902  isopropylmalate isomerase small subunit  72.96 
 
 
197 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2136  isopropylmalate isomerase small subunit  73.6 
 
 
197 aa  310  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1922  isopropylmalate isomerase small subunit  72.45 
 
 
197 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1968  isopropylmalate isomerase small subunit  72.45 
 
 
197 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821719  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09070  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.47 
 
 
197 aa  308  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.656133  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18550  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  71.64 
 
 
204 aa  308  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6005  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.71 
 
 
200 aa  306  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  73.1 
 
 
199 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1479  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.62 
 
 
195 aa  299  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113281  normal  0.730621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13002  isopropylmalate isomerase small subunit  69.04 
 
 
198 aa  295  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3297  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68.81 
 
 
202 aa  293  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2847  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  70.77 
 
 
195 aa  292  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  65.98 
 
 
197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  65.98 
 
 
195 aa  270  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  67.68 
 
 
198 aa  267  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  63.59 
 
 
195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4052  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  63.64 
 
 
203 aa  259  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.49 
 
 
195 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1597  isopropylmalate isomerase small subunit  62.38 
 
 
230 aa  255  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1259  isopropylmalate isomerase small subunit  61.98 
 
 
195 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0512287  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  60.31 
 
 
195 aa  247  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4998  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  58.16 
 
 
198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  58.76 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1150  isopropylmalate isomerase small subunit  61.98 
 
 
195 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000354633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  57.44 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 
195 aa  202  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.26 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 
200 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 
200 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  46.46 
 
 
200 aa  190  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 
200 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 
200 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.37 
 
 
216 aa  184  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 
201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 
200 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.21 
 
 
195 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 
200 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1533  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.69 
 
 
202 aa  177  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.721417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 
201 aa  177  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47 
 
 
216 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  44.67 
 
 
201 aa  174  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 
218 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  42.93 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.15 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.43 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  45.19 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  45.67 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 
200 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  43.06 
 
 
213 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  44.71 
 
 
214 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  47.4 
 
 
200 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 
200 aa  167  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.71 
 
 
198 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 
214 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  42.31 
 
 
216 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  42.31 
 
 
216 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 
214 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  41.83 
 
 
216 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.54 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  42.08 
 
 
762 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  47.96 
 
 
772 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.27 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.63 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 
216 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 
216 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  42.31 
 
 
216 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  42.31 
 
 
216 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  44.98 
 
 
215 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  40.55 
 
 
217 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 
217 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 
215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>