186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1362 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
374 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.96 
 
 
349 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.44 
 
 
347 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 
349 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
347 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.13 
 
 
344 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.29 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.75 
 
 
354 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.04 
 
 
343 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.46 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
338 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
358 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
358 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
358 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
365 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
350 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
320 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  31.77 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 
589 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  30.1 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
314 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  31.97 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  30.31 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  29.92 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
325 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  28.37 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 
315 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  28.37 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
358 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.76 
 
 
301 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.77 
 
 
331 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  30.9 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.59 
 
 
357 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
333 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.47 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  29.82 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.28 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.31 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
325 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  26.71 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
321 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  29.24 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1239  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.74 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.27 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  28.57 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.24 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
339 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
305 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.32 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  32.51 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  30.6 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  33.51 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  20.43 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>