293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0978 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
188 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  49.48 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  42.13 
 
 
207 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  37.62 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  40.84 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  38.76 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  31.61 
 
 
146 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 
209 aa  84.3  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  33.93 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  42.62 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  36.61 
 
 
322 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  37.65 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  34.62 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  28.18 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.46 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  41.51 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.17 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.58 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.31 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.31 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  40.2 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  42.27 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  39.47 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  38.18 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  31.48 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  38.53 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.18 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  35 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.18 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00985  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2661  protein tyrosine phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.68 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2614  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2333  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1098  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0114673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  32.31 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00992  hypothetical protein  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1218  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1091  phosphotyrosine-protein phosphatase  28.32 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  35.78 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  33.03 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  42.98 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  36.89 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  29.23 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.24 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.7 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.24 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  38.24 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  33.9 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.22 
 
 
146 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  28.33 
 
 
151 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1308  protein tyrosine phosphatase  30.81 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.96173  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  38.61 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  34.38 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.62 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1727  protein tyrosine phosphatase  26.74 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0489525  normal  0.734916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  25.71 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  35.64 
 
 
144 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  32.04 
 
 
670 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  32.35 
 
 
143 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  33.66 
 
 
143 aa  62  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  33.66 
 
 
143 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 
146 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  27.78 
 
 
150 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  40.78 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  42.11 
 
 
144 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  33.01 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.42 
 
 
383 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06666  phosphatase  33.96 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  35.64 
 
 
144 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  35.64 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  41.75 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.68 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.11 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  39.8 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  37.14 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01967  protein-tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
147 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  42.11 
 
 
144 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2996  tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
147 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0296858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>