277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0674 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 272 aa  527  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  60.77 
 
 		 271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  50.21 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  45.71 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  50.62 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  45.15 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  46.25 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  44.84 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  45.16 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  44.39 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  44.39 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  44.39 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  44.84 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  44.39 
 
 		 249 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  44.44 
 
 		 253 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  42.45 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  45.29 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  45.71 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  43.28 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  43.95 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  43.95 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  44.72 
 
 		 253 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  44.4 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  42.41 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  44.64 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.23 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  44.3 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  41.5 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  44.3 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38.26 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  38.72 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  44.03 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.74 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.65 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  37.29 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.24 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  36.54 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.53 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  35.35 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.07 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  34.03 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.48 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.62 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.64 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  58.18 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.5 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  36.16 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.21 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  34.45 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  30.74 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  32.04 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>