More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0552 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0552  ABC transporter related  100 
 
 
320 aa  607  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.652365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  54.9 
 
 
307 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  61.24 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  63.52 
 
 
350 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  53.05 
 
 
319 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  49.67 
 
 
279 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.52 
 
 
337 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28400  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.62 
 
 
375 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  38.24 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  33.88 
 
 
310 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.18 
 
 
328 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  42.57 
 
 
306 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.82 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.62 
 
 
319 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.39 
 
 
317 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.65 
 
 
316 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  34.63 
 
 
313 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33.55 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  33.55 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  38.31 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  35.62 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
360 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  38.59 
 
 
335 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  42.02 
 
 
335 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  32.23 
 
 
316 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
342 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.24 
 
 
244 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
339 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
250 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  34.73 
 
 
339 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.85 
 
 
322 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  34.55 
 
 
316 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.1 
 
 
309 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.33 
 
 
430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  33.23 
 
 
339 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  39.36 
 
 
305 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  39.41 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  39.41 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  39.41 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 
303 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  38.03 
 
 
301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  32.9 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.28 
 
 
312 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  31.01 
 
 
316 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  37.02 
 
 
319 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  43.15 
 
 
325 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.62 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  31.01 
 
 
316 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.42 
 
 
244 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  33.33 
 
 
339 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
318 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  40.41 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  35.29 
 
 
244 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1353  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 
320 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101008  normal  0.136194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  42.44 
 
 
301 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.39 
 
 
337 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
309 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  38.42 
 
 
244 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  33.33 
 
 
323 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
585 aa  149  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  43.69 
 
 
580 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  34.87 
 
 
244 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  34.87 
 
 
244 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  35.64 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.42 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.65 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  38.42 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.44 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.29 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  35.67 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.89 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.79 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.27 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  35.61 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.07 
 
 
308 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 
314 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 
351 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.39 
 
 
315 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  37.56 
 
 
299 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  36.95 
 
 
244 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  35.2 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  42.86 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  34.87 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.76 
 
 
248 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.35 
 
 
332 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
305 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  40.3 
 
 
284 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
279 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.86 
 
 
338 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 
248 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  32.46 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.63 
 
 
576 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>