More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0107 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0107  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 142 aa  279  7.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  41.01 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  44.27 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  38.51 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1657  transcription antitermination protein NusB  37.01 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.41 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  39.85 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  37.12 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  39.1 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  29.17 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  32.31 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  32.85 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1713  transcription antitermination protein NusB  36.76 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  39.85 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  32.19 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  33.08 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  30.71 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  31.85 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  33.07 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  31.88 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  36.76 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  32.37 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.38 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  32.12 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  35.61 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  38.4 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  29.2 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  43.3 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  38.4 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  31.06 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  38.4 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  33.86 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  38.71 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  37.6 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  29.79 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.51 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  38.4 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  30.99 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  40.91 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  48.19 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  28.57 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  28.57 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.88 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  32.14 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  48.15 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  33.82 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  31.01 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  30.37 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  27.66 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0737  transcription antitermination protein NusB  27.91 
 
 		 207 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  32.12 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  37.23 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  28.57 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  31.58 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  33.09 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  32.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  30.6 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  28.68 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  32.06 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  35.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  30.83 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  28.47 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  34.33 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  34.41 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  33.82 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0571  transcription antitermination protein NusB  25.74 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0698  NusB antitermination factor  23.57 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5015  transcription antitermination protein NusB  26.28 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  30.08 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  32.61 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  31.62 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  31.82 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  34.68 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2471  transcription antitermination protein NusB  27.35 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.526539  hitchhiker  0.00000000554853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  43.66 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  30.15 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>