113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5862 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5862  HrpO family type III secretion protein  100 
 
 		 87 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5645  HrpO family type III secretion protein  97.7 
 
 		 87 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0584455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0755  type III secretion inner membrane protein SctS  71.26 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313382  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1627  type III secretion inner membrane protein SctS  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0675  type III secretion inner membrane protein SctS  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0793494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1958  type III secretion inner membrane protein SctS  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2277  HrpO family type III secretion protein  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2194  HrpO family type III secretion protein  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0638  type III secretion inner membrane protein SctS  67.82 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5927  HrpO family type III secretion protein  58.62 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0431  type III secretion inner membrane protein SctS  57.47 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0732733  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2001  HrpO family type III secretion protein  57.47 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1909  HrpO family type III secretion protein  57.47 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0859  Hrp conserved HRCS transmembrane protein  56.79 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0274249  hitchhiker  0.00877367 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2414  type III secretion protein, HrpO family  47.14 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3009  HrpO family type III secretion protein  42.86 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0448  HrpO family type III secretion protein  45.12 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100595 
 
 
-
 
NC_002620  TC0852  type III secretion inner membrane protein SctS  40.26 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03407  HrcS  55.22 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003361  type III secretion protein YscS  38.46 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01725  Type III secretory pathway, component EscS  39.74 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0046  type III secretion apparatus protein YscS  41.03 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000568257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4229  HrpO family type III secretion protein  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.619618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3740  HrpO family type III secretion protein  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.721629  hitchhiker  0.00976692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4752  HrpO family type III secretion protein  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3511  Type III secretion protein HrpO  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.124338  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4855  HrpO family type III secretion protein  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0047  HrpO family type III secretion protein  39.71 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5429  HrpO family type III secretion protein  43.75 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751272  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3813  HrpO family type III secretion protein  47.92 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3928  HrpO family type III secretion protein  47.92 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3901  HrpO family type III secretion protein  47.92 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1394  type III secretion protein HrcS  35.29 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.26 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.25 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.25 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.25 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5211  type III secretion protein, HrpO family  30.67 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.4 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.05 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.4 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  28.4 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42630  putative translocation protein in type III secretion  40.7 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0188  Spa9  29.49 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  26.83 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.05 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.5 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.94 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2213  type III secretion protein, HrpO family  33.77 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.5 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  32.47 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  25.61 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.74 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3094  hypothetical protein  29.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3079  secretory protein EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3042  EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3011  EpaQ  29.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3199  hypothetical protein  29.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  28.74 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1884  type III secretion protein, HrpO family  38.96 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2019  flagellar biosynthesis protein FliQ  29.27 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  27.63 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.03 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  31.03 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1318  export protein FliQ family 3  29.49 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.82 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  26.25 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.98 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2573  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.88 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2232  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  26.44 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  25.93 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3017  type III secretion apparatus protein EpaQ  28.4 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000282862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3183  type III secretion apparatus protein EpaQ  28.4 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.63 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0847  HrpO family type III secretion protein  28.4 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.693953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4140  type III secretion apparatus protein EpaQ  28.4 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5535  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.07 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.89 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.49 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.27 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.41 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1535  type III secretion system protein BsaX  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  30 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0576  type III secretion system protein BsaX  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0837  type III secretion system protein BsaX  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.392473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.89 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2069  type III secretion system protein BsaX  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1975  HrpO family type III secretion protein  35.9 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2166  HrpO family type III secretion protein  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.770175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2078  HrpO family type III secretion protein  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.624451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0749  type III secretion system protein BsaX  27.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.685572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2279  HrpO family type III secretion protein  35.9 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0217688  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5152  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.29 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458719  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  26.51 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.41 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.27 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  24.69 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  26.51 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>