More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5785 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  476  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  99.16 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  97.49 
 
 		 272 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  96.65 
 
 		 277 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.98 
 
 		 245 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  87.87 
 
 		 248 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  88.41 
 
 		 251 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  84.1 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  79.31 
 
 		 238 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  76.27 
 
 		 237 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.6 
 
 		 242 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  78.02 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.59 
 
 		 242 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.59 
 
 		 242 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.73 
 
 		 239 aa  351  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  64.66 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.26 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  44.02 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  42.55 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 234 aa  195  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  45.85 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.11 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  43.1 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  45.89 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>