More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2316 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  99.18 
 
 
243 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  90.12 
 
 
243 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  88.89 
 
 
243 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  90.12 
 
 
243 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  88.48 
 
 
243 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  89.3 
 
 
243 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  79.01 
 
 
243 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  78.19 
 
 
243 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  78.6 
 
 
243 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  78.6 
 
 
243 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  78.6 
 
 
243 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  78.6 
 
 
243 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  78.19 
 
 
243 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  56.4 
 
 
252 aa  277  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  56.68 
 
 
249 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  53.23 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.56 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.34 
 
 
245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.95 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  48.77 
 
 
245 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  43.9 
 
 
247 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.91 
 
 
245 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  43.5 
 
 
247 aa  207  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.15 
 
 
238 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.35 
 
 
237 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.28 
 
 
236 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.95 
 
 
239 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.28 
 
 
247 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
239 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
246 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  46.37 
 
 
239 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  45.97 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  45.56 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.33 
 
 
240 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.68 
 
 
232 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.01 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.44 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  31.97 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.97 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.97 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.54 
 
 
238 aa  125  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.93 
 
 
238 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.76 
 
 
233 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.23 
 
 
235 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.39 
 
 
238 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.4 
 
 
238 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.56 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.47 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.97 
 
 
236 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  31.56 
 
 
236 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.56 
 
 
236 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.12 
 
 
238 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.38 
 
 
236 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.39 
 
 
234 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  30.2 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.08 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.2 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  35.94 
 
 
249 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.66 
 
 
398 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
904 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.85 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.69 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.15 
 
 
387 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
900 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.81 
 
 
252 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.88 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.79 
 
 
244 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.89 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
878 aa  89.4  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 
882 aa  88.6  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.98 
 
 
408 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.12 
 
 
390 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
907 aa  85.9  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
913 aa  85.5  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.16 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
892 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
865 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
926 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
910 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.56 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.17 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  28.4 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.43 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  30 
 
 
906 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.13 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  28.23 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1432  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.09 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.61 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.48 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
892 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  28.68 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
892 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  27.97 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
924 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  26.24 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>