More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1568 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  98.38 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  95.95 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  95.95 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  95.14 
 
 		 247 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  94.33 
 
 		 247 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  90.69 
 
 		 247 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  49.38 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  46.61 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  43.88 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  36.13 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  37.55 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  29.73 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  31.62 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  36.27 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  35.4 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  29.46 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  29.22 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.96 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.09 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.44 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  24.39 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.58 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  31.37 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  24.39 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.87 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.53 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  28.37 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  27.96 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  27.7 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.19 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  24.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  28.85 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.42 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5126  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.41 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  24.5 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  25.6 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>