More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0724 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.25 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.25 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  96.27 
 
 		 468 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.5 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.5 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  90.5 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  98.01 
 
 		 403 aa  807    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  84.52 
 
 		 412 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.25 
 
 		 404 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  90.5 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  90.5 
 
 		 404 aa  731    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0797  aminotransferase class V  97.51 
 
 		 403 aa  782    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  98.01 
 
 		 403 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2424  aminotransferase class V  83.25 
 
 		 406 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  100 
 
 		 403 aa  823    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  100 
 
 		 403 aa  821    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  98.01 
 
 		 403 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1792  aminotransferase class V  69.13 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.676184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0212  aminotransferase, class V  62.63 
 
 		 414 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  38.73 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  36.9 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  34.9 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  35.62 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  33.51 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 377 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  35.62 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  35.89 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  35.56 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.82 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  33.33 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.89 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.79 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  33.16 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  35.07 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  33.61 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  34.31 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  35.18 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.18 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  34.68 
 
 		 380 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.18 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  33.88 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  32.46 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.34 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  37.12 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  34.07 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  34.6 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  34.05 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  32.96 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  33.24 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  32.16 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  34.48 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.79 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  32.61 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.4 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  33.8 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  32.49 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.85 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.4 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  32.77 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  30.58 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.49 
 
 		 394 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.55 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  36.51 
 
 		 392 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  33.43 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  33.24 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  32.35 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.99 
 
 		 383 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  33.15 
 
 		 362 aa  176  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.87 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  34.55 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  30.71 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.48 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.87 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  27.42 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  30.58 
 
 		 455 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.63 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  30.51 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  30.85 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.82 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  29.29 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  34.73 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  32.08 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  30.95 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.91 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0936  aminotransferase class V  30 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  28.35 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3186  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  29.56 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  30.77 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>