78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0151 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  89.69 
 
 		 662 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  932    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  65.42 
 
 		 657 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  40.71 
 
 		 650 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  34.07 
 
 		 659 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  34.07 
 
 		 659 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  34.3 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  32.29 
 
 		 678 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  30.73 
 
 		 675 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  31.11 
 
 		 659 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  29.66 
 
 		 675 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  29.66 
 
 		 675 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  26.07 
 
 		 635 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  29.69 
 
 		 630 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  32.47 
 
 		 721 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  31.67 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  31.31 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  29.76 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.87 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.99 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 774 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  28.99 
 
 		 617 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  32.46 
 
 		 749 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 791 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.59 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  29.17 
 
 		 649 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.16 
 
 		 810 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  28.47 
 
 		 709 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 710 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.87 
 
 		 542 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.1 
 
 		 704 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  30.48 
 
 		 626 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1241  hypothetical protein  64.71 
 
 		 115 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  27.07 
 
 		 632 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  25.23 
 
 		 782 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  27.07 
 
 		 640 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.93 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.48 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  38.46 
 
 		 754 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.39 
 
 		 653 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  32.06 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.34 
 
 		 551 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  28.02 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  28.02 
 
 		 572 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  28.02 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.55 
 
 		 536 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  22.68 
 
 		 762 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.81 
 
 		 677 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  26.5 
 
 		 640 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.81 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  27.14 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.73 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.81 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.81 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  24.89 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  21.83 
 
 		 644 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  27.47 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  22.96 
 
 		 780 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.7 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  27.31 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  27.31 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  24.78 
 
 		 567 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 599 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 599 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.28 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  29.05 
 
 		 560 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>