More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1879 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  70.57 
 
 		 746 aa  938    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  51 
 
 		 735 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  99.45 
 
 		 728 aa  1412    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  55.46 
 
 		 735 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  71.89 
 
 		 732 aa  951    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  100 
 
 		 728 aa  1423    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  71.71 
 
 		 732 aa  947    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  71.7 
 
 		 739 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  71.55 
 
 		 739 aa  910    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  71.89 
 
 		 732 aa  951    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  45.96 
 
 		 714 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  44.76 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  43.12 
 
 		 714 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  44.6 
 
 		 714 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.52 
 
 		 713 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.25 
 
 		 724 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.2 
 
 		 701 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  36.68 
 
 		 803 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  32.96 
 
 		 720 aa  347  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  34.08 
 
 		 730 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  42.14 
 
 		 518 aa  331  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  40.67 
 
 		 525 aa  330  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  42.89 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.68 
 
 		 474 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  44.99 
 
 		 478 aa  323  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  31.48 
 
 		 738 aa  320  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.85 
 
 		 521 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.22 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  38.85 
 
 		 502 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  37.82 
 
 		 512 aa  301  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.65 
 
 		 504 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  39.92 
 
 		 483 aa  293  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  40.53 
 
 		 504 aa  291  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.74 
 
 		 498 aa  288  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 483 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.07 
 
 		 504 aa  285  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  39.74 
 
 		 572 aa  282  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.03 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.3 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  39.24 
 
 		 482 aa  270  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  36.88 
 
 		 517 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.73 
 
 		 507 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.88 
 
 		 507 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.29 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  39.18 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.04 
 
 		 517 aa  200  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.83 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  39.27 
 
 		 252 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  33.66 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  36.73 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  40.85 
 
 		 240 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  38.57 
 
 		 246 aa  92.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  45.67 
 
 		 223 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  28.66 
 
 		 512 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 		 465 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  35.2 
 
 		 235 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  43.9 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  36 
 
 		 220 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  33.54 
 
 		 226 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  33 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 236 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  29.76 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  37.89 
 
 		 232 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.31 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  32.31 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  31.54 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.51 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.51 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  34.31 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.06 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.54 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.54 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.54 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 242 aa  76.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  39.84 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  42.86 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  40.16 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  40.16 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  31.01 
 
 		 239 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.92 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  29.03 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.15 
 
 		 226 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.54 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.42 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  35.12 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  35.82 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  32.17 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  40.35 
 
 		 220 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>