269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0887 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  99.2 
 
 
471 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
374 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  99.73 
 
 
467 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
471 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
471 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  95.42 
 
 
462 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  98.93 
 
 
468 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
471 aa  772    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  81.62 
 
 
461 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  79.78 
 
 
469 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  78.71 
 
 
461 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  77.69 
 
 
460 aa  597  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  77.38 
 
 
449 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  77.57 
 
 
435 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  76.82 
 
 
449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  76.82 
 
 
449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  77.41 
 
 
461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  62.81 
 
 
429 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  60.55 
 
 
455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  58.56 
 
 
463 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  58.56 
 
 
463 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  58.58 
 
 
441 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  54.12 
 
 
424 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  53.83 
 
 
433 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  50.14 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.61 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.35 
 
 
536 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.1 
 
 
536 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.1 
 
 
536 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  49.1 
 
 
536 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.59 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  48.71 
 
 
473 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  48.71 
 
 
473 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  47.55 
 
 
449 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  48.45 
 
 
473 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  47.95 
 
 
480 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  46.29 
 
 
480 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  47.29 
 
 
472 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  47.29 
 
 
473 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  47.8 
 
 
472 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.69 
 
 
451 aa  311  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.61 
 
 
476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  42.82 
 
 
454 aa  305  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  39.03 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.38 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.12 
 
 
468 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.6 
 
 
413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  42.59 
 
 
436 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  42.47 
 
 
461 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  42.47 
 
 
461 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  42.47 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  42.2 
 
 
474 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  42.2 
 
 
456 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  41.67 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  42.12 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  41.24 
 
 
448 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.21 
 
 
433 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  40.05 
 
 
540 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  41.13 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.05 
 
 
540 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  40.05 
 
 
540 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.78 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.78 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.78 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.78 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.41 
 
 
543 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  38.26 
 
 
446 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  37.83 
 
 
446 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  38.24 
 
 
390 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  35.05 
 
 
361 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  34.92 
 
 
378 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.49 
 
 
196 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  33.15 
 
 
353 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  32.77 
 
 
422 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  28.38 
 
 
346 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.28 
 
 
357 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  31.48 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.75 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  30.52 
 
 
369 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.86 
 
 
419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  29.89 
 
 
377 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.92 
 
 
379 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.55 
 
 
451 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  31.99 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  29.35 
 
 
417 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.2 
 
 
333 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 
768 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  28.22 
 
 
453 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  30.72 
 
 
338 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  31.1 
 
 
626 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.48 
 
 
311 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.53 
 
 
365 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30.43 
 
 
346 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 
431 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  26.63 
 
 
360 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  25.74 
 
 
613 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  29.04 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  29.74 
 
 
346 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0370  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase) (CCP)  27.99 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  29.76 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0979676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>