285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1584 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
517 aa  1038    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  63.57 
 
 
514 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  64.01 
 
 
515 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  63.65 
 
 
533 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  64.34 
 
 
526 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 
530 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  60.85 
 
 
514 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  61.76 
 
 
530 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  61.69 
 
 
534 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 
514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  60.45 
 
 
544 aa  579  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  60.4 
 
 
537 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  59.77 
 
 
517 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  64.79 
 
 
503 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  58.49 
 
 
518 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  62.13 
 
 
514 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  54.3 
 
 
512 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  54.3 
 
 
512 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  52.17 
 
 
509 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  43.28 
 
 
507 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  46.2 
 
 
508 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.58 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 
516 aa  395  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  42.75 
 
 
511 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  44.21 
 
 
507 aa  385  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  46.77 
 
 
513 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  45.65 
 
 
506 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  45.17 
 
 
506 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  45.85 
 
 
499 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  42.97 
 
 
520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  41.38 
 
 
498 aa  356  6.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.76 
 
 
536 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
524 aa  349  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  43.01 
 
 
516 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  45.16 
 
 
517 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
505 aa  342  8e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 
526 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  40.26 
 
 
489 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  40.57 
 
 
523 aa  339  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
506 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  40.62 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
505 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
505 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
505 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  45.78 
 
 
508 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
505 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  45.78 
 
 
508 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  40.21 
 
 
505 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  42.58 
 
 
508 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
505 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  40 
 
 
505 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  45.78 
 
 
508 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  40.21 
 
 
505 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.1 
 
 
508 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  40.77 
 
 
512 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  40.97 
 
 
510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  39.26 
 
 
533 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 
528 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.27 
 
 
504 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  40.74 
 
 
497 aa  320  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  40.66 
 
 
510 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  40.52 
 
 
510 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4004  histidine ammonia-lyase  37.1 
 
 
537 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187247  normal  0.249864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
510 aa  316  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  40.73 
 
 
511 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  38.95 
 
 
510 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
513 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  38.18 
 
 
503 aa  316  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.64 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  39.24 
 
 
513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  39.07 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  39.55 
 
 
513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  39.52 
 
 
513 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  39.63 
 
 
514 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  40.24 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  39.52 
 
 
513 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  39.52 
 
 
513 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  39.52 
 
 
513 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  39.64 
 
 
515 aa  309  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
563 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  39.3 
 
 
517 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  42.12 
 
 
515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  39.64 
 
 
511 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  35.21 
 
 
528 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  38.17 
 
 
511 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  39.74 
 
 
514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
533 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
507 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
507 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
507 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1029  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 
510 aa  303  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0827766  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
529 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>