141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7235 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  55.33 
 
 		 243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  53.54 
 
 		 236 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  54.92 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  57.36 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  51.79 
 
 		 237 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  50 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  49.02 
 
 		 243 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  55.84 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  46.77 
 
 		 242 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  49.48 
 
 		 251 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  46 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  45.31 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  46.15 
 
 		 241 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  43.43 
 
 		 245 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  37.1 
 
 		 562 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  34.67 
 
 		 559 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  38.25 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  38.32 
 
 		 245 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  36 
 
 		 561 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  44 
 
 		 274 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  38.65 
 
 		 248 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  32.56 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  32.26 
 
 		 260 aa  89  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  34.88 
 
 		 997 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  30.6 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.46 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  37.11 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  32.86 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  30.95 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 447 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.78 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  31.7 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.93 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  31.73 
 
 		 454 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  36.31 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  30.77 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  30.97 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  33.8 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  31.4 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  30.92 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  31.4 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  32.37 
 
 		 692 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.63 
 
 		 566 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  37.2 
 
 		 550 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  32.37 
 
 		 449 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.98 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.57 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  32.99 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  33 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.85 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.81 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.71 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  31.6 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.16 
 
 		 248 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  31.73 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  30.13 
 
 		 570 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  31.4 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.72 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.57 
 
 		 652 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.13 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  31.96 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.71 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  29.05 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  30.19 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  32.32 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.81 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  30.88 
 
 		 662 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  31.96 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  31.9 
 
 		 674 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.35 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  29.55 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  37.19 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  29.06 
 
 		 710 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  29.35 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  29.73 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  32.86 
 
 		 453 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  30.27 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  28.28 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.66 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  26.45 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.13 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  28.97 
 
 		 724 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  27.23 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  29.95 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  25.66 
 
 		 693 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  29.09 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  25.25 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.41 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  27.43 
 
 		 680 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  27.75 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  31.32 
 
 		 571 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  31.1 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  27.67 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  27.67 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  28.5 
 
 		 670 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  32.82 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>