165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4613 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  100 
 
 		 313 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  54.26 
 
 		 318 aa  340  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  52.08 
 
 		 315 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  49.84 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  50.48 
 
 		 320 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  49.19 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  49.21 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  46.89 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  43.85 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  42.86 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  43.31 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  43.31 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  36.68 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  36.42 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  37.01 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  36.53 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  39.08 
 
 		 379 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  39.08 
 
 		 438 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  38.77 
 
 		 438 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  36.23 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  35.22 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  32.05 
 
 		 479 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  39.87 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  35.13 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  31.57 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  39.55 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  32.52 
 
 		 479 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  40 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.87 
 
 		 481 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  35.03 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  37.74 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  37.94 
 
 		 484 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  34.27 
 
 		 443 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  34.6 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 		 483 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  30.96 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 791 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 777 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  29.16 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 791 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 791 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 844 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  35.81 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  30.41 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 810 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  33.86 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  32.47 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  32.21 
 
 		 416 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  32.21 
 
 		 416 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.37 
 
 		 491 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  33.45 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  32.11 
 
 		 456 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  35.5 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  40 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.62 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  35.03 
 
 		 412 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  38.98 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  30.57 
 
 		 498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  32.77 
 
 		 479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  34.58 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.05 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  37.29 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  38.84 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  38.84 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.92 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  38.43 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  34.23 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  33.92 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  33.92 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  33.92 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  33.92 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  35.89 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.98 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  33.48 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  32.99 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  32.31 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  33.48 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  33.48 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  32.06 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  32.75 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  32.16 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  30.77 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  36.61 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  34.77 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  33.86 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  32.6 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  30.13 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  30.65 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  26.01 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  31.09 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  33.91 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  36.16 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  36.12 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  36.12 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  32.6 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  30.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  31.73 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  30.86 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>