40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4187 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1010    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.65 
 
 		 760 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  34.69 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  35.42 
 
 		 828 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.18 
 
 		 1154 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  29.74 
 
 		 690 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  32.26 
 
 		 688 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  29.82 
 
 		 417 aa  94.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27.89 
 
 		 409 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.78 
 
 		 861 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  27.64 
 
 		 1308 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 3193 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  26.47 
 
 		 3041 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.8 
 
 		 1372 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  30.04 
 
 		 912 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.26 
 
 		 940 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  30.64 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1289 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.28 
 
 		 1557 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  24.92 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  28 
 
 		 883 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  25.43 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  22.6 
 
 		 811 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.65 
 
 		 1838 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1328 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 		 2346 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 959 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.2 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  27.87 
 
 		 813 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  27.56 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.82 
 
 		 1126 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  25.94 
 
 		 974 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  27.04 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.64 
 
 		 889 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.93 
 
 		 1118 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  25.38 
 
 		 1437 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.72 
 
 		 620 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.68 
 
 		 1340 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.08 
 
 		 1113 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>