More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4173 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  41.02 
 
 		 844 aa  663    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  79.4 
 
 		 889 aa  1395    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  56.3 
 
 		 905 aa  969    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  100 
 
 		 895 aa  1816    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 		 889 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  78.03 
 
 		 899 aa  1382    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  75.05 
 
 		 919 aa  1373    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  77.99 
 
 		 895 aa  1409    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  78.14 
 
 		 889 aa  1406    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  73.79 
 
 		 944 aa  1359    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 		 885 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  40.12 
 
 		 863 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 863 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  40.12 
 
 		 863 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  40.52 
 
 		 863 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  40.12 
 
 		 862 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  40.75 
 
 		 869 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 		 903 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  37.52 
 
 		 831 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 917 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 		 842 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 		 859 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 		 868 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 772 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 610 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  39.81 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  37.38 
 
 		 535 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  40 
 
 		 536 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  38.39 
 
 		 533 aa  199  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  41.09 
 
 		 540 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  41.37 
 
 		 650 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  36.65 
 
 		 558 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  38.14 
 
 		 638 aa  197  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  36.24 
 
 		 558 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 521 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  37.93 
 
 		 538 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.13 
 
 		 522 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  39.53 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  39.26 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  39.53 
 
 		 525 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  37.23 
 
 		 494 aa  189  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  36.87 
 
 		 532 aa  184  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 		 529 aa  183  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 501 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 501 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  27.82 
 
 		 501 aa  137  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 546 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 		 295 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 488 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.23 
 
 		 295 aa  121  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.18 
 
 		 672 aa  121  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 492 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.02 
 
 		 652 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  32.02 
 
 		 652 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.21 
 
 		 768 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 508 aa  119  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  29 
 
 		 672 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  26.83 
 
 		 716 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  28.67 
 
 		 672 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 505 aa  116  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  31.58 
 
 		 788 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  31.58 
 
 		 788 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  30.71 
 
 		 737 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  30.83 
 
 		 778 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  30.49 
 
 		 666 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 494 aa  114  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.23 
 
 		 712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  29.1 
 
 		 749 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.01 
 
 		 652 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  25.06 
 
 		 740 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.04 
 
 		 661 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 620 aa  111  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  29.26 
 
 		 788 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  26.8 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 514 aa  108  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  29.97 
 
 		 726 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  28.25 
 
 		 683 aa  106  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.76 
 
 		 586 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.34 
 
 		 544 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.25 
 
 		 422 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 425 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 659 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.04 
 
 		 624 aa  104  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.1 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.23 
 
 		 930 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.66 
 
 		 804 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 537 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 425 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 425 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  26.42 
 
 		 741 aa  101  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.26 
 
 		 831 aa  101  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 1231 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  30.12 
 
 		 707 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  29.32 
 
 		 845 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.55 
 
 		 980 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>