More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2260 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  100 
 
 		 390 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  78.72 
 
 		 390 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  64.71 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  64.29 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  63.28 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  64.01 
 
 		 388 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  64.03 
 
 		 390 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  61.62 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  60.61 
 
 		 389 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  61.7 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  59.9 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  59.64 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  65.3 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  62.76 
 
 		 390 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  60.57 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  60.15 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  60.36 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  60.26 
 
 		 390 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  60.05 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  58.21 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  59.13 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  58.21 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  62.47 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  56.44 
 
 		 388 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  56.59 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  56.41 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  56.33 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  58.35 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  56.85 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  55.78 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  55.27 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  55.38 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  55.01 
 
 		 387 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  56.04 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  54.9 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  51.03 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  52.97 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  52.07 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  52.85 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  50.9 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  52.97 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  53.21 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  51.03 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  50.65 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  51.16 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  53.99 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.74 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  51.04 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.93 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.37 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  54.81 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  51.04 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.55 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  51.15 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  50.25 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  50.26 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  51.68 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  51.03 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  51.92 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  50 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.5 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.65 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  53.93 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  53.93 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  54.2 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  53.93 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  54.2 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  54.2 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  50.39 
 
 		 408 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.89 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.89 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.74 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  46.81 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  50 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.89 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  51.65 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.37 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  50.78 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  51.4 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  49.1 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  47.65 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.48 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.34 
 
 		 397 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  50.38 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.45 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.62 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.61 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.38 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.38 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  50.51 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>