More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1549 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  65.82 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 201 aa  247  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 201 aa  247  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  247  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  247  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4715  two component LuxR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2665  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 133 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2336  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 133 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103968  normal  0.760096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.4 
 
 		 589 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  34.74 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 365 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 407 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.03 
 
 		 348 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  31.94 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 227 aa  88.6  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.04 
 
 		 350 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  31.65 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  29.78 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  32.11 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4740  two component LuxR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 160 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318753  normal  0.272493 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1718  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0955826  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 306 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  37.69 
 
 		 352 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 767 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.98 
 
 		 352 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.52 
 
 		 354 aa  85.1  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 242 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  30.18 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  84.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  27.75 
 
 		 242 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  33.13 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  27.8 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.19 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  32.5 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.86 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  30.09 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  29.96 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  30.09 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  29.65 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 846 aa  82  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  29.65 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3617  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  37.59 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.61 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.46 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  30.52 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  30.32 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  39.5 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>