More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0993 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  45.09 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  43.75 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.67 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 236 aa  187  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  44.4 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  45.25 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  42.67 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  46.32 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  44.64 
 
 		 228 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.95 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.02 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>