More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.29 
 
 
590 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.29 
 
 
590 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  87.24 
 
 
590 aa  802    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  86.56 
 
 
590 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  88.38 
 
 
590 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29790  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
439 aa  901    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.29 
 
 
590 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  88.61 
 
 
590 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.49 
 
 
590 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.58 
 
 
590 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  94.31 
 
 
590 aa  860    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  94.31 
 
 
590 aa  860    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  93.17 
 
 
590 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.12 
 
 
590 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.75 
 
 
590 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
588 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
588 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
589 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2932  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606648  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00683  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00672  hypothetical protein  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0815  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.233209  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0736  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.73 
 
 
588 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
588 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0828  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.18 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0890  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.18 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0767  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.18 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0857  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.18 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484772 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0793  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.18 
 
 
588 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83395  normal  0.0589165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.59 
 
 
588 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0642  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.5 
 
 
588 aa  611  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.59 
 
 
588 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.59 
 
 
588 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.91 
 
 
588 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.91 
 
 
588 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.91 
 
 
588 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.91 
 
 
589 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.45 
 
 
588 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.29 
 
 
590 aa  591  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00659831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.64 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.77 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.55 
 
 
588 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1834  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.77 
 
 
588 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00255629  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.61 
 
 
589 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.55 
 
 
588 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.55 
 
 
588 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.77 
 
 
588 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.32 
 
 
588 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.32 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.32 
 
 
588 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.77 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.55 
 
 
588 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.5 
 
 
588 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.95 
 
 
588 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.41 
 
 
588 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.22 
 
 
589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.22 
 
 
589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.27 
 
 
588 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.18 
 
 
588 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.59 
 
 
588 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.95 
 
 
587 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.95 
 
 
587 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.72 
 
 
595 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.35 
 
 
591 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.35 
 
 
591 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
592 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  56.26 
 
 
584 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
591 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.21 
 
 
591 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.44 
 
 
591 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.12 
 
 
601 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.44 
 
 
591 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
591 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.99 
 
 
591 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.56 
 
 
602 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  51.89 
 
 
602 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.18 
 
 
591 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.85 
 
 
592 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.85 
 
 
592 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.85 
 
 
592 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.5 
 
 
592 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.21 
 
 
587 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.62 
 
 
592 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.08 
 
 
592 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  51.45 
 
 
601 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>