86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_02510  Thymidylate kinase  100 
 
 
189 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0344  thymidylate kinase  26.38 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2993  thymidylate kinase  33.14 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.207274 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0357  thymidylate kinase  24.87 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  33.77 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1020  thymidylate kinase  31.82 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  33.76 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  29.7 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30960  thymidylate kinase  34.97 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0156  dTMP kinase  26.67 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0126  thymidylate kinase  27.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1026  dTMP kinase  30.86 
 
 
254 aa  52  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  37.84 
 
 
207 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  32.89 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1194  dTMP kinase  27.74 
 
 
205 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  33.12 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  33.8 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0144  dTMP kinase  26.67 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.049684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  28.95 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46855  predicted protein  30.72 
 
 
245 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00892903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  33.93 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  27.59 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  30.86 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  30.86 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  32.17 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  27.45 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0288  thymidylate kinase  30.14 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.395544  normal  0.185713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  32.99 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  28.22 
 
 
209 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  31.17 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  27.03 
 
 
212 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  33.33 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  29.14 
 
 
216 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1750  thymidylate kinase  35 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126977  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  31.65 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  27.03 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  32.91 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0456  thymidylate kinase  30.77 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  33.11 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  29.45 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1726  thymidylate kinase  32.87 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1625  thymidylate kinase  29.45 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1246  dTMP kinase  27.81 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.180167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  27.98 
 
 
219 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  29.33 
 
 
211 aa  45.1  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0559  thymidylate kinase  28.97 
 
 
199 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  29.19 
 
 
219 aa  44.7  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0300  dTMP kinase  25.69 
 
 
205 aa  44.7  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.188613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  29.86 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  29.45 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  32.46 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1654  thymidylate kinase  32.17 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.969892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1411  thymidylate kinase  31.13 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0670165  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  34.56 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1788  thymidylate kinase  27.07 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  25 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1841  thymidylate kinase  28.91 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  27.03 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  34 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  31.71 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  30.67 
 
 
224 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  32.84 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6504  thymidylate kinase  33.57 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0480023  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  31.54 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  29.81 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  29.81 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  30.91 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  28.66 
 
 
213 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4251  thymidylate kinase  34.03 
 
 
213 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.993209  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  31.29 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  31.29 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  29.81 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  29.05 
 
 
206 aa  41.2  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  30.91 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  30.91 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  25.3 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.37 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  30.91 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>