More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3858 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  996    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  81.95 
 
 		 484 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  79.88 
 
 		 488 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  81.78 
 
 		 485 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 493 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 494 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 493 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 493 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 493 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 493 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 493 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 503 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 506 aa  441  1e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 500 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 476 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 492 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.09 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 498 aa  332  8e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 485 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 492 aa  329  8e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 479 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 		 503 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 490 aa  319  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 504 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 535 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 496 aa  315  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 510 aa  309  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 464 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 485 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 502 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 502 aa  302  9e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 485 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 488 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  36.42 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 511 aa  296  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 509 aa  296  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 480 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 504 aa  295  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>