More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2585 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
333 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.55 
 
 
334 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
327 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
333 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.19 
 
 
329 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
334 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  29.07 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
352 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
332 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  26.49 
 
 
329 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.79 
 
 
330 aa  99.4  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.24 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0918  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387082  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  27.51 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1660  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375362  normal  0.750578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00873  predicted NAD(P)H-binding oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.4 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0332928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
349 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00879  hypothetical protein  24.4 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0435323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
349 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1028  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.779011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
349 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1680  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
325 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0210493  normal  0.642206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0896  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.4 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 
368 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854455  normal  0.343267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17440  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.75 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
321 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.96 
 
 
364 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  26.25 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  25.52 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2464  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.63 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.954565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4056  dehydrogenase, putative  26.71 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.66 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
349 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
746 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0932  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.94 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.67 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1049  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.95 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1030  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.95 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0967  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.95 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0999  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.65 
 
 
337 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.32 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.37 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  26.84 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.85 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0028  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.11 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170519  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.15 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2591  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.14 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
321 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  24.3 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.65 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.21 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  24.64 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.36 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  26.56 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3118  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.93 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  25.98 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  27.34 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>