More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0220 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
368 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854455  normal  0.343267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.76 
 
 
431 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.171088  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 
334 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 
333 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
746 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.03 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.76 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  33.16 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.47 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.35 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.47 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.47 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  21.35 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0684  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.32 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
322 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.809623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
312 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  25.37 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07140  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.04 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  27.57 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.39 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.89 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13250  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.83 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.986779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.86 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
307 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  27.21 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1239  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.89 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.54 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  24.91 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.11 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.68 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  26.76 
 
 
329 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  27 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.47 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  32.48 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.05 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1660  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375362  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
316 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  31.97 
 
 
324 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
304 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.54 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.96 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.82 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.62 
 
 
335 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>