More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3427 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
327 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
334 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
333 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
368 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854455  normal  0.343267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
333 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
334 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.171088  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2608  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.22 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
331 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
746 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
336 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2011  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.36 
 
 
330 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0266  hypothetical protein  25.39 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  23.94 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
320 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.32 
 
 
326 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.66 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  27.95 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  23.64 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  30.33 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.31 
 
 
366 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
324 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
315 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.44 
 
 
387 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
349 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
326 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  29.31 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.74 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.22 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.22 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.49 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
322 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2712  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.84 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2545  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.65 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  29.22 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.58 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.22 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.93 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.22 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.23 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.34 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71224  Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating  24.43 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12365 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.45 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.44 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.84 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  26.77 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.04 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  26.81 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.97 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  26.95 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.19 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  31.7 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  21.36 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>