169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1230 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1230  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00155806  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 
645 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 
600 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.52 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  21.83 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
627 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  21.83 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 
234 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  21.4 
 
 
395 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  21.4 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  21.89 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  21.4 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  24.49 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  23.46 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  21.4 
 
 
437 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  28.84 
 
 
224 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  26.69 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  23.24 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  21.74 
 
 
316 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  23.24 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  25.79 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  27.48 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.16 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
615 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.4 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.4 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 
510 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  21.86 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 
615 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  25.18 
 
 
373 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  23 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 
361 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  27.91 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  22.76 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  26.85 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  26.39 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  26.85 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  26.85 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  23.71 
 
 
352 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  25.1 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.74 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 
353 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  23.59 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  28.43 
 
 
673 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.35 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.46 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  26.73 
 
 
590 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  24.08 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 
357 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
348 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 
237 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 
342 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  26.79 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  26.79 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 
367 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.38 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  22.11 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  25.66 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  30.5 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  26.79 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  24.04 
 
 
900 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  22.84 
 
 
554 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>