83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4488 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4193  hypothetical protein  57.04 
 
 
296 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4293  hypothetical protein  57.04 
 
 
296 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4462  hypothetical protein  57.04 
 
 
296 aa  295  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4591  BNR/Asp-box repeat-containing protein  50.83 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3532  BNR/Asp-box repeat-containing protein  43.9 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18350  hypothetical protein  43.64 
 
 
288 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04910  hypothetical protein  43.64 
 
 
288 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4533  hypothetical protein  37.37 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4569  hypothetical protein  36.62 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1454  hypothetical protein  37.96 
 
 
279 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1436  hypothetical protein  37.96 
 
 
279 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0625  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.96 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5735  hypothetical protein  35.48 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3170  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.3 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3069  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.4 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0890  hypothetical protein  35.1 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1610  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.68 
 
 
303 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.428774  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4247  hypothetical protein  41.54 
 
 
258 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3503  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.48 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1763  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1905  BNR repeat domain protein  30.9 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00957934  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0269  group-specific protein  25.53 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0197  putative lipoprotein  25.53 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1660  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.21 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1762  BNR repeat-containing protein  28.07 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1935  BNR repeat domain protein  28.07 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54365e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1711  group-specific protein  28.07 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1739  hypothetical protein  28.07 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1726  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.5 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1900  BNR repeat-containing protein  30.99 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00252899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.1 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  30.77 
 
 
403 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  36.5 
 
 
661 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  25.38 
 
 
1032 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.99 
 
 
1060 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.65 
 
 
630 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.17 
 
 
652 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  28.06 
 
 
681 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.35 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.55 
 
 
1041 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.47 
 
 
1078 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  33.79 
 
 
742 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  28.35 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.65 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.08 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  29.41 
 
 
1043 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  30.81 
 
 
1220 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  28.41 
 
 
912 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  27.81 
 
 
1048 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.45 
 
 
1044 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.49 
 
 
597 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  26.29 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  31.82 
 
 
315 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  27.92 
 
 
1117 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.9 
 
 
931 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 
909 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  26.16 
 
 
999 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.63 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.97 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  29.83 
 
 
1054 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  23.18 
 
 
1527 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.68 
 
 
1021 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.67 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  26.7 
 
 
1147 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  26.63 
 
 
421 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.32 
 
 
757 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  24.23 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  32 
 
 
942 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  24.8 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  27.31 
 
 
1060 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1509  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  26.84 
 
 
1083 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  37.74 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  26.7 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.93 
 
 
780 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  31.25 
 
 
925 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.69 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.5 
 
 
694 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  30.06 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  30.06 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  28.48 
 
 
479 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>