More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3908 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  87.87 
 
 		 268 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.41 
 
 		 254 aa  344  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  63.12 
 
 		 261 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.74 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.3 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.04 
 
 		 636 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.23 
 
 		 636 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  65.35 
 
 		 636 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  64.96 
 
 		 598 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  65.35 
 
 		 636 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  65.35 
 
 		 636 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  65.35 
 
 		 636 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.29 
 
 		 594 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.22 
 
 		 602 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  62.83 
 
 		 264 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.3 
 
 		 636 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  64.29 
 
 		 619 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.23 
 
 		 594 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.02 
 
 		 597 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  65.02 
 
 		 597 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.02 
 
 		 597 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  61.3 
 
 		 257 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  61.69 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  63.71 
 
 		 272 aa  327  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.31 
 
 		 595 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.88 
 
 		 595 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  62.02 
 
 		 254 aa  325  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  59.85 
 
 		 263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02260  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.93 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.903253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  64.31 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.96 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  63.47 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  60.3 
 
 		 260 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  59.18 
 
 		 274 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.75 
 
 		 592 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  60.45 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 256 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0404  ABC transporter related  60.74 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  60.78 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  60.78 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.7 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  59.3 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  61.02 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  59.61 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  60.55 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  60.15 
 
 		 262 aa  305  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  61.02 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  57.63 
 
 		 263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  59.16 
 
 		 259 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  56.49 
 
 		 263 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  58.37 
 
 		 254 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  57.25 
 
 		 256 aa  301  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  58.53 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  59.3 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.97 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  59.69 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  58.53 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.45 
 
 		 581 aa  295  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  57.25 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  56.69 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  55.98 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.53 
 
 		 276 aa  288  8e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 		 254 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.94 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  55.64 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 		 268 aa  281  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  56.63 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.22 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.9 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  54.3 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  54.12 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  54.12 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 252 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  52.99 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.08 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.03 
 
 		 249 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.73 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.8 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.1 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.36 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.47 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.12 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 270 aa  275  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  56.15 
 
 		 245 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  55.02 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.12 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>