More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3865 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  81.3 
 
 
517 aa  815    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  100 
 
 
539 aa  1054    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  53.46 
 
 
488 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  53.46 
 
 
488 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  50.48 
 
 
491 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  52.4 
 
 
492 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  52.22 
 
 
488 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  44.65 
 
 
895 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
482 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  50.19 
 
 
512 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
541 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  51.73 
 
 
475 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  52.12 
 
 
475 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  36.81 
 
 
571 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.82 
 
 
568 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.96 
 
 
605 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.17 
 
 
574 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  33.66 
 
 
548 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.72 
 
 
568 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.35 
 
 
553 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
484 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.85 
 
 
495 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  35.37 
 
 
510 aa  227  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  33.33 
 
 
483 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.1 
 
 
541 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  32.82 
 
 
557 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  39.58 
 
 
494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.88 
 
 
550 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 
566 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  34.37 
 
 
581 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.14 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.95 
 
 
564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
558 aa  213  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
566 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.84 
 
 
558 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.43 
 
 
566 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.79 
 
 
593 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 
566 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 
566 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 
568 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.52 
 
 
810 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
530 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.6 
 
 
582 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.79 
 
 
568 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  35.18 
 
 
574 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 
566 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.21 
 
 
573 aa  207  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.79 
 
 
590 aa  207  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.21 
 
 
566 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 
467 aa  206  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  34.27 
 
 
568 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.2 
 
 
579 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.99 
 
 
566 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.48 
 
 
512 aa  204  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.9 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.2 
 
 
569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.08 
 
 
568 aa  200  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 
770 aa  200  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.44 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.82 
 
 
570 aa  198  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.82 
 
 
570 aa  198  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  33.54 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.46 
 
 
531 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.81 
 
 
497 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 
470 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  30.43 
 
 
466 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  30.43 
 
 
466 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 
551 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.11 
 
 
593 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.65 
 
 
628 aa  193  7e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.31 
 
 
571 aa  193  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  30.67 
 
 
587 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.4 
 
 
509 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.95 
 
 
537 aa  190  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.42 
 
 
501 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.69 
 
 
562 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.62 
 
 
528 aa  189  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.64 
 
 
656 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.6 
 
 
469 aa  187  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33 
 
 
526 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.74 
 
 
558 aa  186  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.17 
 
 
534 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.26 
 
 
493 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.27 
 
 
811 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  32.67 
 
 
456 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 
489 aa  183  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  27.93 
 
 
478 aa  183  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.01 
 
 
458 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  28.88 
 
 
490 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 
502 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
551 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.51 
 
 
495 aa  180  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
551 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.62 
 
 
541 aa  180  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.93 
 
 
491 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 
553 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 
553 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 
551 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.28 
 
 
481 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.14 
 
 
535 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>