More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3059 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  350  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  81.07 
 
 		 168 aa  286  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  32.35 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  37.82 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  44.96 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  39.1 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  39.44 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 160 aa  97.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  38.3 
 
 		 157 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  38.03 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  45.63 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  40.13 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  39.82 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  91.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  33.81 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 148 aa  91.3  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  35.42 
 
 		 146 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  35.42 
 
 		 146 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.5 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.33 
 
 		 165 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 		 121 aa  87.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  32.89 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  39.84 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 135 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 145 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  35.71 
 
 		 212 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 147 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  42.55 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  33.09 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  35.88 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  34.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  41.51 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2618  HxlR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  34.97 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  34.03 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  34.03 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>