168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2745 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  87.88 
 
 		 263 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  72.4 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2107  phage shock protein A, PspA  70.94 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  70.94 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  68.98 
 
 		 256 aa  334  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  75 
 
 		 252 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  64.96 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0842  phage shock protein A, PspA  61.09 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  0.505696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07000  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  60 
 
 		 238 aa  284  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1451  phage shock protein A, PspA  61.54 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0888103  normal  0.107078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  31.97 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  31.72 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.97 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  32.72 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  35.86 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  29.66 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.04 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  29.89 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  30.51 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  30.51 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  30 
 
 		 221 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.15 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  31.3 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  34.91 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.51 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  31.22 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  32.34 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  30.6 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  29.17 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1403  phage shock protein A, PspA  28.24 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146053  normal  0.0292837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  28.96 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  28.76 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  30.28 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  28.04 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  29.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  29.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  28.81 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  28.81 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  29.82 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.8 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  29.82 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  31.03 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  28.21 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  28.21 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  28.18 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  27.78 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  27.73 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  30.86 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  27.89 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  25.22 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  29.03 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  26.96 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  30.52 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  31.53 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  26.29 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  28.33 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  25.65 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  26.09 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  26.61 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  26.09 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  26.09 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  26.09 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  26.09 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  26.42 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  22.8 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1492  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00023246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  26.96 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  27.93 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  25.94 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1360  phage shock protein A, PspA  25.88 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1345  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1319  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1318  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1454  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000577339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1528  PspA/IM30 family protein  26.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70975e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  27.24 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  26.5 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  30.95 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  26.09 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>