65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0426 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 536 aa  1100    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  56.74 
 
 		 527 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.19 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 557 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  28.8 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.7 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 585 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.44 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 553 aa  95.9  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.1 
 
 		 556 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  23.29 
 
 		 586 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 544 aa  89.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.06 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.83 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.59 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  25.57 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.43 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 567 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 571 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  21.24 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 567 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 523 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.44 
 
 		 526 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 565 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 425 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 522 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 533 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 424 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>