More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0205 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.62 
 
 
668 aa  636    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  48.42 
 
 
684 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  49.47 
 
 
678 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  51.35 
 
 
672 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  49.69 
 
 
654 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.69 
 
 
647 aa  652    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 
662 aa  1371    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  44.33 
 
 
684 aa  570  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  44.49 
 
 
682 aa  567  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  43.57 
 
 
751 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  41.86 
 
 
710 aa  524  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  41.29 
 
 
701 aa  503  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  36.22 
 
 
679 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  26.18 
 
 
712 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.98 
 
 
749 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.17 
 
 
731 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.86 
 
 
731 aa  218  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.52 
 
 
736 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  27.89 
 
 
729 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  27.27 
 
 
740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.59 
 
 
639 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  28.26 
 
 
748 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.15 
 
 
822 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.55 
 
 
633 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.94 
 
 
654 aa  211  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.35 
 
 
841 aa  211  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.84 
 
 
621 aa  210  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  26.84 
 
 
754 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  27.12 
 
 
746 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  29.29 
 
 
659 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  28.61 
 
 
659 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.2 
 
 
785 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  26.11 
 
 
652 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  29.52 
 
 
674 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  28.84 
 
 
1240 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  26.78 
 
 
759 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  28.66 
 
 
716 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 
1224 aa  205  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  27.4 
 
 
742 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.99 
 
 
630 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.63 
 
 
721 aa  203  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.62 
 
 
741 aa  203  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  26.58 
 
 
755 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  26.72 
 
 
754 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  26.58 
 
 
755 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.44 
 
 
668 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.76 
 
 
747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  25.3 
 
 
729 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  31.48 
 
 
730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  27.45 
 
 
723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  26.31 
 
 
621 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  27.5 
 
 
754 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  26.51 
 
 
727 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  26.69 
 
 
754 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  31.89 
 
 
768 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  26.24 
 
 
733 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  30.33 
 
 
812 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  34.17 
 
 
722 aa  201  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  31.89 
 
 
768 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.55 
 
 
770 aa  200  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.74 
 
 
742 aa  199  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.24 
 
 
670 aa  200  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.16 
 
 
736 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.71 
 
 
784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  32.13 
 
 
725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  32.59 
 
 
740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.24 
 
 
741 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.71 
 
 
784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  33.05 
 
 
743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  31.51 
 
 
736 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  32.48 
 
 
728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  26.37 
 
 
732 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 
756 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  26.21 
 
 
732 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  32.77 
 
 
743 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  27.95 
 
 
729 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  31.33 
 
 
1320 aa  197  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  26.28 
 
 
725 aa  197  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  32.77 
 
 
743 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  32.77 
 
 
743 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  28.18 
 
 
716 aa  197  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  26.83 
 
 
764 aa  197  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.33 
 
 
732 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.41 
 
 
768 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  26.99 
 
 
735 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  31.94 
 
 
731 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.55 
 
 
646 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  32.49 
 
 
745 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  31.41 
 
 
749 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  26.73 
 
 
736 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  26.11 
 
 
765 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  30.64 
 
 
695 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.92 
 
 
728 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  29.57 
 
 
749 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  32.04 
 
 
785 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  27.59 
 
 
728 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  30.83 
 
 
755 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  26.12 
 
 
725 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  25.58 
 
 
725 aa  194  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  32.87 
 
 
736 aa  194  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>