More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0707 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  41.3 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  40.09 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  38.26 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  38.07 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  31.58 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  34.96 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  32.17 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  30.8 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.01 
 
 		 202 aa  99  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  45.53 
 
 		 202 aa  98.6  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  32.47 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  35.29 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  34.68 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  36.94 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  32.11 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.21 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  33.94 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  31.53 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  35.35 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  31.65 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  46.46 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  40.77 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  50.5 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  33.03 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  31.51 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1914  hypothetical protein  32.74 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  38.98 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  30.73 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  30.73 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  29.6 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  29.82 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  43.43 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  30.49 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  40.94 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  29.68 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  31.05 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  28.51 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.4 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  29.34 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  40.78 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  28.69 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  33.04 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  29.55 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  42.72 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  33.33 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>