179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0509 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
275 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.91 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  36.14 
 
 
275 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
269 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.39 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  34.29 
 
 
275 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  34.41 
 
 
274 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  42.62 
 
 
276 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  31.25 
 
 
269 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.42 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 
180 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.19 
 
 
275 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0878  hypothetical protein  26.96 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.86 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.58 
 
 
207 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.58 
 
 
207 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.13 
 
 
209 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40.98 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.85 
 
 
271 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.27 
 
 
179 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.31 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.62 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.04 
 
 
274 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.62 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.84 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  38.24 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  40 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.26 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  41.94 
 
 
271 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  38.16 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  29.7 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  38.89 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.44 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  39.68 
 
 
274 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  40.54 
 
 
271 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.02 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  26.21 
 
 
271 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
180 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  35.44 
 
 
178 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.23 
 
 
278 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40 
 
 
157 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.05 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.05 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.05 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.05 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.92 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.21 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.05 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  35.44 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  31.63 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  44.62 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  34.67 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  29.91 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  32.14 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.54 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  35.48 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.03 
 
 
179 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  39.06 
 
 
178 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000191061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 
178 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.28 
 
 
177 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  32.81 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.71 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.87 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  29.71 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  35.14 
 
 
271 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  34 
 
 
275 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  40.62 
 
 
448 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.67 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.18 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  38.1 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  35.48 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  26.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.68 
 
 
445 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  32.99 
 
 
274 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  35 
 
 
449 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>