More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5028 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  53.8 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  43.58 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 		 264 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  35.16 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  36 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  49.28 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  49.15 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  42.86 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  47.27 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  29.7 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>