More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  100 
 
 		 289 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  33.68 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33.45 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33.45 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  33.33 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.42 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.99 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.79 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.13 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.12 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  31.23 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  35.29 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  32.03 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.61 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  30.27 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.66 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  32.74 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.96 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.38 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.65 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.71 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.59 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  33.68 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  32 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.16 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.58 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  27.92 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.08 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.85 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.46 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.7 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  25.86 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  29.17 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.35 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.19 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  26.57 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  26.21 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.91 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.64 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  32.73 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.03 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.9 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17190  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.29 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  26.12 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  26.74 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  31.23 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  29.17 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  27.49 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  27.36 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2126  NmrA family protein  24.53 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  29.82 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  29.51 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  29.66 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  39.05 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  26.06 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  23.31 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  25.85 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  49.25 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  46.27 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  26.76 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  29.1 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  31.08 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  29.79 
 
 		 512 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  45.21 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  25.78 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.29 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.94 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.52 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  26.26 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  42.86 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  28.07 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 		 352 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  27.78 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  45.83 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  27.95 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  27.95 
 
 		 280 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  44.16 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  42.25 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  27.43 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.11 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.11 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  26.53 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  27.85 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  30.85 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  33.04 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  48.57 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  29.44 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  32.88 
 
 		 486 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>