More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  100 
 
 		 407 aa  828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  68.87 
 
 		 408 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  68.22 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  58.33 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  54.64 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  49.75 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  48.01 
 
 		 409 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  47.51 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  47.51 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  47.51 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  51.3 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  45.87 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  45.87 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  49.38 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  45.63 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  45.22 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  44.2 
 
 		 408 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  47.87 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  47.01 
 
 		 399 aa  328  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  43.27 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  47.75 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  41.29 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  41.29 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  47.99 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  44.67 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  44.44 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  45.14 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  44.86 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  46.19 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  46.29 
 
 		 410 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  42.96 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  42.93 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  44.84 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  41.85 
 
 		 408 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  42.86 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  44.78 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  43.19 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  42.45 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.47 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  40.4 
 
 		 411 aa  282  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.68 
 
 		 406 aa  282  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.86 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  41.96 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.68 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  42.21 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  42.56 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  41.01 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.01 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  44.5 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  41.01 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  41.19 
 
 		 414 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40.95 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  39.22 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.23 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.6 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.8 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.18 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.23 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  38.29 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  41.27 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  39.3 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  40.35 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  43.31 
 
 		 345 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.75 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.4 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.14 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.74 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.6 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  40.2 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.44 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.44 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40.46 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.55 
 
 		 423 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.56 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.8 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.01 
 
 		 405 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.11 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.04 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.72 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.05 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.99 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.89 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  36.91 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36.75 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.11 
 
 		 411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.33 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.91 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.91 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.79 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.64 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.23 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  35.96 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.52 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.55 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.06 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.15 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>