More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2662 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2662  Methionine--tRNA ligase  100 
 
 		 542 aa  1096    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2149  methionine--tRNA ligase  60.34 
 
 		 536 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3624  Methionine--tRNA ligase  43.24 
 
 		 513 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  32.68 
 
 		 671 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  31.85 
 
 		 662 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  32.94 
 
 		 749 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 682 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 699 aa  194  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 680 aa  190  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 702 aa  189  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 702 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 711 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 691 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 702 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 693 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 700 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  31.12 
 
 		 659 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 690 aa  178  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 689 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  26.29 
 
 		 557 aa  176  7e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 705 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 688 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 		 592 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  30.88 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 599 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 567 aa  161  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 734 aa  160  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 565 aa  160  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 577 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 595 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 606 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1818  methionyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 710 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 611 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 544 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  27.25 
 
 		 593 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 599 aa  148  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 605 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 596 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 544 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 544 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 565 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 544 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  26.92 
 
 		 625 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 600 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 544 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2749  methionyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 499 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0342203  normal  0.0114918 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 		 617 aa  143  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 565 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 544 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 597 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 597 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 540 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2964  hypothetical protein  29.18 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07748  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  23.62 
 
 		 734 aa  139  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0283  methionyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 531 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 684 aa  133  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3666  methionyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 573 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 675 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 600 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  27.85 
 
 		 658 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 678 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  24.11 
 
 		 672 aa  130  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 		 676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 705 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 717 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 		 676 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03104  methionyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 496 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 		 680 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>